DNA topological regulation by topoisomerase IIβ-DNA-PK interaction is important for controlled hypoxia-inducible gene expression

Cette étude révèle que l'interaction entre la topoisomérase IIβ et la kinase DNA-PK, médiée par la phosphorylation de la topoisomérase IIβ, régule la topologie de l'ADN pour contrôler l'expression des gènes inductibles par l'hypoxie en réprimant leur transcription en conditions normoxiques et en permettant leur activation lors de l'hypoxie.

Bunch, H., Park, J., Solverson, J. K. + 11 more2026-04-12📄 molecular biology

Structure from Noise: Confirmation Bias in Particle Picking in Structural Biology

Cette étude révèle que les méthodes de sélection de particules en cryo-microscopie électronique, qu'elles soient basées sur l'appariement de modèles ou sur des réseaux de neurones, peuvent générer artificiellement des structures moléculaires à partir de bruit pur en raison du biais de confirmation, et propose des stratégies pour atténuer ce risque critique.

Balanov, A., Zabatani, A., Bendory, T.2026-04-12📄 molecular biology

Diverse bacterial pattern recognition receptors sense the core phage proteome

Cette étude révèle que les récepteurs de reconnaissance de motifs bactériens de la superfamille STAND détectent de manière diversifiée le protéome central des phages, en particulier via la reconnaissance de la protéine de capside majeure par la famille Avs7 et de douze autres protéines phagiques conservées par d'autres familles STAND, illustrant ainsi des stratégies immunitaires fondées sur la reconnaissance structurelle et le recyclage de facteurs hôtes.

Lee, H., Luengo-Woods, S., Zhang, J. + 9 more2026-04-12📄 molecular biology

More than just a passive brick in the wall: the nucleosome facilitates DNA polymerase β activity in linker DNA and its PARP-dependent regulation in the BER pathway choice

Cette étude révèle que le nucléosome, loin d'être un simple obstacle, stimule l'activité de la polymérase β dans l'ADN de liaison et orchestre, via une régulation dépendante des PARP, le choix entre les voies de réparation par excision de base courte et longue, tout en atténuant l'inhibition exercée par l'histone H1.

Shtanov, D. M., Kurgina, T. T., Kutuzov, M. M. + 4 more2026-04-12📄 molecular biology

The lncRNA FENDRR fine-tunes FOXF1 protein levels through a negative feedback loop governing human embryonic lung fibroblast-to-myofibroblast transition

Cette étude révèle que l'ARNnc FENDRR, transcrit divergemment du gène FOXF1, agit dans une boucle de rétroaction négative pour affiner finement les niveaux de la protéine FOXF1, régulant ainsi la transition fibroblaste-myofibroblaste et le développement pulmonaire embryonnaire, dont la perturbation est impliquée dans la dysplasie alvéolo-capillaire (ACDMPV).

Laurendeau, J.-F., Mockly, S., Duran Bishop, G. + 5 more2026-04-12📄 molecular biology

Multi-objective Engineering of Trimethylamine Monooxygenase for Improved Thermostability and Cofactor Use

Cette étude explore une stratégie d'ingénierie multi-objectif pour améliorer la thermostabilité et la compatibilité avec le cofacteur NADH de la monooxygénase à triméthylamine, révélant que bien que des combinaisons de méthodes permettent de préserver l'activité NADPH après traitement thermique, l'obtention d'une fonction NADH robuste sous contrainte thermique reste un défi majeur.

Xiang, R., Floor, M., Ree, R. + 5 more2026-04-12📄 molecular biology

Repurposed small molecule toxin inhibitors neutralise a diversity of venoms from the Neotropical viperid snake genus Bothrops

Cette étude démontre que des médicaments existants repurposés, notamment des inhibiteurs de métalloprotéinases et de phospholipases, neutralisent efficacement une diversité de venins du genre *Bothrops*, offrant ainsi une solution prometteuse pour le traitement précoce des morsures de serpents en Amérique néotropicale.

Clare, R. H., Westhorpe, A., Stars, E. + 4 more2026-04-11📄 molecular biology

"Editing the conserved IPA1-TB1 regulatory module reshapes plant architecture and enhances tillering in wheat

En utilisant l'édition génomique CRISPR/Cas9 pour modifier le module régulateur conservé TaIPA1-TaTB1, cette étude démontre qu'il est possible d'augmenter significativement le nombre de tiges et le poids des grains chez le blé, offrant ainsi une stratégie prometteuse pour l'amélioration du rendement.

Vishnoi (Equal contribution), R., Augustine (Equal contribution), G., Sirohi, P. + 12 more2026-04-11📄 molecular biology

Targeted sequencing of mutations via RNA-templated gap filling of oligonucleotides for single-cell RNA-seq

Cette étude présente une méthode de séquençage ciblé des mutations exprimées dans des cellules uniques, exploitant l'activité de comblement de lacunes et de ligature de l'ADN polymérase Bst sur un modèle d'ARN pour permettre le profilage simultané du transcriptome entier et de mutations multiplexées au sein d'une même cellule.

Saurty-Seerunghen, M. S., Lee, H., Holdar, M. + 8 more2026-04-11📄 molecular biology

In-cell structural insights into fungal ER stress responses

En combinant la cryo-microscopie électronique à tomographie et l'analyse de sous-tomogrammes, cette étude révèle que le stress du réticulum endoplasmique chez *S. cerevisiae* induit une expansion de cet organelle, une activation de l'autophagie et une augmentation modeste des ribosomes 80S inactifs liés à des facteurs d'élongation, suggérant ainsi un mécanisme de traduction inhibée pour atténuer ce stress.

Jager, L. d., Dorst, S. v., Kugler, H. + 4 more2026-04-11📄 molecular biology

Learning latent conformational landscapes encoded in cryo-EM

Cette étude démontre que les données cryo-EM peuvent être organisées en un paysage conformationnel probabiliste physiquement fondé, permettant non seulement de valider la plausibilité des états moléculaires et d'identifier des intermédiaires biologiques significatifs, mais aussi d'améliorer la reconstruction structurale grâce à une sélection de particules guidée par la probabilité.

Dai, H., Shen, Y., Chen, Q. + 10 more2026-04-11📄 molecular biology

Neuron-specific epigenetic repression of Cdk5 impairs hippocampal-dependent memory in male and female mice

Cette étude démontre que la répression épigénétique neuronale spécifique de Cdk5, obtenue par déacétylation ciblée de l'histone, altère la mémoire dépendante de l'hippocampe chez les souris mâles et femelles, révélant ainsi un mécanisme de régulation transcriptionnelle commun aux deux sexes.

Rodriguez-Acevedo, K. L., Winter, J. J., Alvarez, M. I. + 3 more2026-04-10📄 molecular biology

Transcriptional and spatial profiling of fibroblasts from human lungs highlights CTHRC1+ cells as fibrogenic signaling hubs in fibrosis

Cette étude intègre le séquençage ARN monocellulaire et la transcriptomique spatiale pour révéler que les fibroblastes CTHRC1+ constituent des hubs de signalisation fibrogénique dans la fibrose pulmonaire idiopathique, tout en démontrant que les cultures cellulaires standard altèrent significativement l'identité transcriptionnelle native de ces cellules.

Vanegas-Avendano, N. D. P., Chen, H., Wellmerling, J. H. + 11 more2026-04-10📄 molecular biology

Dual Recognition Drives Site-Directed G-Quadruplex Stabilization: Exploring Oligonucleotide Design in G4 Ligand-Oligonucleotide Conjugates

Cette étude démontre que la conception rationnelle d'oligonucléotides conjugués à des ligands de G-quadruplexes permet une reconnaissance et une stabilisation ciblées de ces structures grâce à une reconnaissance duale synergique combinant l'hybridation séquentielle et la liaison du ligand.

Abrahamsson, A., Khwaja, S., Vertueux, S. + 9 more2026-04-10📄 molecular biology